Analiza genomului Covid-19 relevă originea dublă a virusului Health Magazine
Covid-19: analiza genomului ar dezvălui o dublă origine a virusului
Virusul SARS-CoV-2 responsabil pentru pandemia Covid-19 face obiectul a numeroase analize genetice în întreaga lume pentru a-i înțelege originea și evoluția.
În câteva săptămâni, am învățat cu toții o mulțime de lucruri, dar am auzit și câteva zvonuri despre boala Covid-19 și virusul responsabil: SARS-CoV-2. În timp ce numărul lucrărilor științifice despre acest virus continuă să crească, există încă multe zone gri despre originea acestui virus.
În ce specii de animale a apărut? Un liliac, un pangolin sau alte animale sălbatice? De unde este el ? Dintr-o peșteră sau o pădure din provincia chineză Hubei sau în altă parte ?
În decembrie 2019, 27 din primele 41 de persoane spitalizate (66%) au trecut printr-o piață situată în inima orașului Wuhan, în provincia Hubei. Dar originea epidemiei nu este probabil legată de contactul cu animale vii sau moarte prezente pe această piață, deoarece se pare, potrivit unui studiu chinez efectuat la spitalul din Wuhan, că primul caz uman identificat nu a vizitat această piață.
În acord cu această ipoteză, datarea moleculară estimată din secvențele genomice ale SARS-CoV-2 indică mai degrabă o origine în noiembrie. Prin urmare, avem dreptul să ne întrebăm despre legătura dintre această epidemie Covid-19 și viața sălbatică.
Ce știm din datele genomice ale Betacoronavirusurilor
Genomul SARS-CoV-2 a fost rapid secvențiat de cercetătorii chinezi. Este o moleculă de ARN de aproximativ 30.000 de baze conținând 15 gene, inclusiv gena S care codifică o proteină localizată pe suprafața învelișului viral (pentru comparație, genomul nostru este sub forma unei duble spirale ADN de aproximativ 3 miliarde de baze în dimensiune și conține aproape 30.000 de gene).
Analizele genomice comparative au arătat că SARS-CoV-2 aparține grupului de betacoronavirusuri și că este foarte apropiat de SARS-CoV, responsabil pentru o epidemie de pneumonie acută care a apărut în noiembrie 2002 în provincia chineză Guangdong care s-a răspândit apoi în 29 de țări, în special în Franța în 2003.
Au fost înregistrate în total 8.098 cazuri, inclusiv 774 decese. Știm că liliecii din genul Rhinolophus (potențial mai multe specii de peșteri) au fost rezervorul acestui virus și că un mic carnivor, civeta de palmier (Paguma larvata), ar fi putut servi ca gazdă intermediară între lilieci și lilieci. Primele cazuri umane.
De atunci, au fost descoperite multe Betacoronavirusuri, în principal la lilieci, dar și la oameni. Astfel, virusul RaTG13, izolat dintr-un liliac din specia Rhinolophus affinis colectată în provincia chineză Yunan, a fost recent descris ca fiind foarte apropiat de SARS-CoV-2, secvențele genomului lor fiind 96% identice. Aceste rezultate indică faptul că liliecii și, în special, speciile din genul Rhinolophus, constituie rezervorul virusurilor SARS-CoV și SARS-CoV-2.