Terminator (genetică) - biologie

Cand Terminator sau Terminator de transcriere este o parte a unei secvențe genetice pe ADN care marchează sfârșitul unei gene sau operon. Aceasta duce la încetarea transcrierii.

Două clase de terminatori transcripționali sunt cunoscuți în procariote:

  • Terminatori de transcripție intrinsecă
  • Terminatori de transcripție dependenți de Rho

Terminatorul constă de obicei dintr-o scurtă secvență (4-10) de perechi de baze GC și este situat în ARN aproape imediat după codonul de oprire, care descrie sfârșitul ORF. Proteinele care blochează încetarea transcripției se numesc antiterminatoare.

Terminare independentă de Rho

Cu acest tip de terminație, se dezvoltă o structură secundară în formă de ac de păr în transcrierea ARN. Motivul stă în secvența specială a bazelor.

Structura optimă pentru un terminator intrinsec [1] rezultă după cum urmează:

biologie

  • Regiunea bogată GC care formează tulpina 1 (6-8 perechi de baze)
  • Regiune de formare a buclei (3-5 perechi de baze)
  • Regiunea bogată GC care formează tulpina 2 (6-8 perechi de baze)
  • Regiunea poliuracilă (3-8 perechi de baze)

Cele două regiuni bogate în GC se reunesc pentru a forma așa-numitul trunchi. Regiunea dintre formează așa-numita buclă sau buclă. Această structură a acului de păr are ca rezultat o lungă pauză în alungire. Acest lucru se corelează în proporție directă cu stabilitatea structurii acului. Următoarele 3-8 reziduuri de uracil destabilizează complexul de alungire [2]. Teoria populară este că structura acului de păr scurtează hibridul ARN/ADN și perechea instabilă a UA destabilizează și mai mult complexul. Consecința acestui fapt este respingerea transcrierii [3] .

Importanța structurii acului de păr pentru terminare

Structura acului de păr contribuie la terminare în două moduri [4] [5]

  • Structura ARN a acului de păr duce la o inhibare alosterică a adaosului de nucleotide la locul activ. Aceasta va opri RNAP.
  • Structura acului de păr asigură o separare a hibridului ARN - ADN la capătul 5’–.

Terminarea dependentă de Rho

Spre deosebire de terminatorii intrinseci, terminarea dependentă de rho nu conține elemente de secvență ADN destabilizatoare. Aici terminarea este catalizată de factorul de terminare Rho. Complexul de alungire este destabilizat de activitatea helicazei a factorului Rho [6]. Rho recunoaște secțiunile bogate în C pe transcriere aici ca hexamer. Se leagă de o zonă lungă de aproximativ 100 bp în amonte de complexul de alungire de pe transcriptul ARN nou sintetizat. Rho se deplasează spre capătul 3 'al ARN datorită activității sale ATPază. Această activitate helicază a factorului de terminare duce la o separare a hibridului ARN/ADN. Consecința este disocierea complexului de alungire și eliberarea rezultată a transcriptului ARN [7] .

Distincţie

Secvențele terminatoare de pe ADN trebuie să se distingă de codonii terminatori de pe ARNm, ceea ce duce la încetarea traducerii.