Interviul exclusiv al proiectului Pmeasyr Blogul tuturor PMSI
Am dori să subliniem proiectul pmeasyr, un pachet în R, limbajul dedicat statisticilor bine cunoscut pentru DIM, care permite efectuarea de analize PMSI în mod independent, inclusiv pe baze de date mari PMSI de câteva mii de linii. Este un proiect open source, născut la AP-HP, care gestionează toate domeniile PMSI (MCO, SSR, PSY, HAD și ACE). Descoperiți pmeasyr în videoclip
Câteva rezultate posibile cu pmeasyr:
# MCO rămâne cu un cod sau o familie de coduri de diagnostic, indiferent de pozițiile lor DP, DR sau DAS (de exemplu: rămâne cu un cod de epilepsie)
# MCO rămâne cu actul EBLA003 „Plasarea unui cateter conectat la o venă profundă”, indiferent de RUM în care este codat actul
# coadă activă a pacienților cu un cod de obezitate în E66 în instituție și/sau în funcție de poziția de codare a codului de obezitate
# fișier activ al intervenției chirurgicale, făcând distincție între activitățile CCAM
# DMS activat rămâne mai mult de 0 zile
# DMS de GHM/GHS
Pentru a afla mai multe, am intervievat Guillaume PRESSIAT, la inițiativa acestui proiect, care a avut amabilitatea de a răspunde la întrebările noastre.
Buna ziua domnule PRESSIAT. Câteva cuvinte de introducere în proiectul pmeasyr. Ne puteți spune cum a apărut acest proiect în cadrul AP-HP DIM? Pentru a satisface ceea ce are nevoie analiza PMSI pe care software-ul actual de analiză și statistici PMSI nu le îndeplinește ?
Bună ziua, ideea inițială a fost să mă concentrez pe software-ul pe care îmi place să îl folosesc. Aceasta nu înseamnă abandonarea altor programe, dar R poate concentra majoritatea etapelor unui studiu: importul datelor, efectuarea analizelor, producerea unui document care prezintă rezultatele pentru comunicarea lor. Jonglăm prea des între mai multe software-uri, ceea ce reprezintă o sursă de erori și confuzie.
Prin urmare, proiectul s-a născut dintr-o nevoie pe care o împărtășesc cu medicii Dim, stagiarii din domeniul sănătății publice și statisticienii de a avea acces la date cu o anumită libertate de utilizare, la nivelul șederii, dacă este posibil fără software pe piață. Nu voi detalia istoria proiectului aici: în esență, în 2016, crearea unui grup de utilizatori R printre Dim AP-HP a deschis pachetul către alți utilizatori și a făcut posibilă formalizarea utilizării pachetului. Difuzarea în afara AP-HP prin github a fost implementată, cu următoarea idee: cei care au nevoie de o astfel de soluție o pot folosi și o pot îmbunătăți participând, dacă doresc.
Interogările posibile sunt destul de nelimitate (limitate de ideile și datele utilizatorilor). Pentru a da un exemplu diferit de cele prezentate pe site, este destul de ușor și rapid să faci înlănțuire intra/inter-câmp și astfel să descrii călătoriile pacientului. De asemenea, putem realiza cu ușurință hărți interactive și vizualizări în R.
Ce echipă lucrează în prezent la dezvoltarea pmeasyr la AP-HP ?
Sunt dezvoltatorul pmeasyr și am colegi de statisticieni și medici dim în jurul meu care folosesc pachetul, îmi aduc ideile, observațiile și comentariile lor.
Aș dori să mulțumesc membrilor grupului R Users de la AP-HP. În special, dr. Namik Taright (sediul DIM - DOMU - AP-HP) pentru îndrumări și idei, dr. Kristel Cosker (HU Pitié Salpêtrière) pentru utilizarea pachetului, disponibilitatea sa și toate observațiile sale, precum și dr. Rémi Flicoteaux (HU Saint Louis Lariboisière) pentru motivația sa și căile de lucru pe care le oferă.
IMG-urile din diferite unități AP-HP funcționează cu pmeasyr? Care sunt întoarcerile lor ?
Unele AP-HP Dims folosesc pachetul, feedback-ul lor îmi permite să îmbunătățesc documentația și pachetul în sine. Feedback-ul pozitiv se referă tocmai la documentația care permite un început bun; Am primit un alt feedback cu privire la ușurința de utilizare a pachetului. Un feedback mai negativ se referă la anii acoperiți de pachet (anul de început este 2011), în timp ce pentru unele studii clinice (cohorte) este necesar să existe date mai vechi: în acest caz pmeasyr nu este adecvat. Acest punct de plecare îl explic în 2011 prin faptul că, începând din acest an, formatele au devenit mai omogene.
Aveți contact cu alte spitale? Există vreunul dintre ei care lucrează deja sau intenționează să lucreze pe pmeasyr ?
Am avut contacte de la mai mulți CH din Franța. Am descoperit această dimensiune interesantă prin deschiderea unui instrument: interacțiunea cu oameni care exercită aceeași slujbă ca noi, dar în diferite categorii de unități. Întrebările lor se referă la instalarea pmeasyr, formatul de date sau sunt inerente instrumentelor ATIH și transmisiilor lamda și uneori se referă la R în general. Feedback-ul lor asupra pachetului este destul de pozitiv.
La deschiderea pachetului, ne-am gândit la utilizarea acestuia în contextul implementării GHT-urilor: punerea în comun a datelor PMSI (sunt în același format), activitate, coadă activă, studiul călătoriilor pacienților în GHT intra ...