Proteomica găsește țintele terapeutice potrivite

Rezumatul fișierului

După genomică, iată studiul sistematic al proteinelor. Permite descoperirea markerilor bolii și a țintelor terapeutice.

În 1995, când cercetătorul australian post-doctoral Marc Wilkins a vorbit pentru prima dată despre proteom (cum ar fi setul de proteine dintr-o celulă), habar nu avea că introduce o știință cu totul nouă.
Cu toate acestea, proteomica este considerată astăzi a fi cel mai promițător proiect de biotehnologie. Și asta, într-un moment în care decriptarea genomului uman este aproape completă.

„Proteomica reprezintă studiul produsului finit al expresiei unei gene, și anume proteina”, explică Jérôme Garin, directorul laboratorului de chimie a proteinelor CEA din Grenoble.

Markeri de boală
Această disciplină constă în cuantificarea și identificarea tuturor proteinelor unei celule într-un mediu dat. Prin compararea proteinelor probelor sănătoase și bolnave, putem deduce care dintre acestea sunt specifice unei patologii. Aceste proteine devin apoi markeri ai bolii în cauză, baza noilor diagnostice. Dar ele sunt, de asemenea, potențiale ținte pentru medicamente viitoare împotriva acestei patologii.

Una dintre primele companii de biotehnologie care a dezvoltat conceptul de proteomică a fost Oxford GlycoSciences din Marea Britanie (vezi I&T # 805). Mai întâi în parteneriat cu Universitatea din Oxford: au fost descoperite aproximativ cincizeci de proteine specifice cancerului. Apoi, cu cele mai mari grupuri farmaceutice.
În cadrul programului, din 1998: căutarea proteinelor specifice bolii Alzheimer și aterosclerozei (cu Pfizer), astmului și altor boli pulmonare (cu Bayer), diabet (cu Merck) și cancere (cu Incyte).

Rețineți că OGS dezvoltă și proteomică vegetală. Parteneriatul său cu Pioneer Hi-Bred (grupul Du Pont de Nemours) își propune să identifice proteinele asociate creșterii culturilor, în special porumbul.

Identificați sute de proteine pe zi
Proteomica se bazează în principal pe două tehnici analitice: electroforeză bidimensională și spectrometrie de masă. Electroforeza în gel 2D separă proteinele dintr-un amestec în soluție pe baza sarcinii lor electrice și a masei moleculare. În cele din urmă, fiecare pată vizualizată pe gel (prin colorare sau marcare radioactivă, fluorescentă) Conține o proteină diferită. "Mai mult de o mie de proteine pot fi astfel analizate pe un gel de electroforeză 2D", specifică Jérôme Garin, de la CEA din Grenoble.

Odată separate, proteinele sunt identificate prin spectrometrie de masă. Această tehnică accelerează serios sarcina cercetătorilor. Anterior, au identificat una sau două proteine pe zi, prin secvențierea chimică (metoda Edman). Datorită unui spectrometru de masă de tip Maldi TOF (desorbție cu laser asistat prin matrice-Timp de zbor), acestea pot caracteriza câteva sute pe zi.

Principalii producători de acest tip de dispozitive sunt Perkin Elmer Biosystems (care a creat un centru de cercetare proteomică în martie trecută), Amersham Pharmacia Biotech, Bruker și Micromass.

Principiul: o proteină identificată pe gelul de electroforeză este tăiată în peptide sub acțiunea unei enzime. Spectrometrul măsoară masele acestor peptide și oferă o „hartă a peptidelor de masă” pe care este suficient să o compare cu o bază de date pentru a identifica proteina. (Compania americană Proteome oferă în acest context bănci de proteomi pentru om, animale și microorganisme).