Originea fecalelor; Mesaj @ Arheologie Online
O nouă metodă de diferențiere a surselor de materie paleofecală oferă informații importante cercetătorilor
Excrementele sunt omniprezente în înregistrările arheologice și reprezintă o potențială mină de aur pentru cunoștințele despre dietă și sănătate la momentul respectiv, dezvoltarea paraziților și ecologia și evoluția microbiomului. Principala problemă pentru cercetători este de a determina ale cui precipitate sunt de fapt examinate. Un nou studiu condus de Maxime Borry și Christina Warinner de la Institutul Max Planck pentru Istoria Omului din Jena (MPI-SHH) prezintă acum „coproID”, o metodă de încredere pentru determinarea originii materiei paleofecale.
Învățarea automată permite o clasificare fiabilă
După mii de ani, determinarea originii fecalelor poate fi dificilă. În special, distincția dintre fecalele umane și cele pentru câini este complicată, deoarece ambele sunt similare ca dimensiune și formă, apar în aceleași locuri și au o compoziție comparabilă. Această problemă este agravată de faptul că câinii erau în meniul multor societăți anterioare și că câinii au tendința de a mânca fecale umane. Testele genetice simple sunt problematice, deoarece pot detecta ADN-ul ambelor specii.
Pentru a avea acces la descoperirile conținute în materia paleofecală, echipa internațională de cercetători din oamenii de știință din MPI-SHH, Universitatea Harvard și Universitatea din Oklahoma a dezvoltat coproID (identificare coprolit). Metoda combină analiza ADN-ului vechi al gazdei cu software-ul care folosește învățarea automată pentru a recunoaște microbiomii în excremente. Prin aplicarea coproID-ului atât la seturile de date recent secvențiate, cât și la cele deja publicate, echipa a reușit să determine în mod fiabil originea fecalelor arheologice și să arate că o combinație de ADN-ul gazdei și diferitele colonii de microbi care trăiesc în interiorul oamenilor și câinilor, permite o diferențiere exactă a fecalelor lor.
Clasificarea oferă o perspectivă asupra sănătății digestive
„Un rezultat neașteptat al studiului nostru este că descoperirile arheologice arată o mare parte din excrementele câinilor”, spune prof. Christina Warinner, autorul principal al studiului. Warinner se așteaptă, de asemenea, ca coproID să găsească o gamă și mai largă de aplicații, de exemplu în cercetarea criminalistică, ecologică și microbiomă.
Abilitatea de a determina cu exactitate originea excrementelor arheologice permite studierea directă a modificărilor structurii și funcției florei intestinale umane în timp. Echipa de cercetare speră că acest lucru va oferi o perspectivă asupra intoleranței alimentare și a altor probleme de sănătate umană. „Identificarea coprolitelor umane ar trebui să fie primul pas în analiza microbiomilor umani antici”, spune Maxime Borry, primul autor al studiului.
„Cu mai multe date despre metagenomii florei intestinale a câinilor non-occidentalizați, putem clasifica acum în siguranță și mai multe probe de fecale ca fecale de câine și nu doar la fel de„ nesigure ””, adaugă Borry. Pe măsură ce crește cantitatea de date, este de așteptat ca clasificarea prin coproID și, astfel, sprijinul cercetătorilor care întâlnesc paleo-fecale într-o serie de contexte istorice și geografice să continue să se îmbunătățească.