TD Biochimie n; 4, electrofor; se, Exp 1

Experimentul 1: Construirea unei bănci de ADN genomic pentru Candida albicans.

Scopul experimentului:

Pentru a crea o bibliotecă de mutație de inserție (a unui marker), trebuie mai întâi să construiți o bibliotecă de ADN genomic. Biblioteca de inserție va fi utilizată pentru a găsi gene implicate în formarea biofilmului în Candida albicans. Această ciupercă oportunistă este întâlnită frecvent la pacienții imunosupresionați (de exemplu SIDA), unde invadează membranele mucoase și provoacă Candidoza (foto). Cu toate acestea, colonizarea suprafețelor (și formarea unui biofilm), cum ar fi cea a cateterelor vasculare, este, de asemenea, o problemă importantă în medicină (infecții nosocomiale), deoarece poate provoca candidoză „diseminată” (care poate provoca leziuni grave la potențialul toate organele interne).

cuvânt înainte: Instrucțiuni:

Aveți nevoie de revizuiri? Aici este: Introducere
Aveți la dispoziție 25 de minute pentru a efectua experimentul. Nu pierde prea mult timp.
Citiți cu atenție descrierea experimentului. Când vi se cere să faceți o alegere, gândiți-vă la asta și faceți clic pe răspunsul care are cel mai mult sens pentru dvs.
Chiar dacă ați răspuns corect, nu uitați să citiți celelalte opțiuni.
Răspunsurile la întrebările din cursiv apar de obicei pe o altă pagină html (faceți clic pe întrebare). Nu vă îndreptați asupra acestor întrebări.
Întrebările cu roșu vor fi discutate în timpul sintezei experienței.
Dacă nu finalizați experimentul în timpul alocat, îl puteți face din nou mai târziu. Adresa web a experienței este legată pe Dokeos.
Îmi puteți trimite întotdeauna comentariile dvs. prin e-mail: [email protected].

Această experiență virtuală este inspirată de experiențe reale, cu toate acestea, pentru a face tutorialul mai interesant și a încuraja întrebări, au fost făcute adaptări (dintre care unele sunt puțin probabil).

Introducere:

Convenție: 1Mb = 1'000 kb = 1'000'000 bp. Aceasta este o modalitate de a cuantifica dimensiunea moleculelor de ADN, în nucleotide pereche. Fiecare aminoacid (aa) este codificat (pe ADN/ARN) de un grup de 3 nucleotide (= codon). Un ORF (= cadru de citire deschis; parte a genei care codifică proteina) de măsurare

Prin urmare, 1kb codifică o proteină de

Candida albicans este o ciupercă diploidă, unicelulară (eucariotă inferioară) care crește ca o singură celulă și hife (filamente ale celulelor conectate). Biofilmul format din C. albicans este alcătuit din celule unicelulare, pseudohipalice și chiar hifale și o matrice extracelulară formată din polizaharide și proteine. Acest biofilm protejează C. albicans în special împotriva antifungicilor. Formarea biofilmului are loc în trei etape: prima formă se formează colonii unicelulare; apoi celulele adoptă o conformație pseudohipală și produc o matrice extracelulară. În cele din urmă, matricea și filamentele (hifa) cresc împreună.