Stagiul biochimic II - Descărcare gratuită PDF
1 Stagiu biochimic II Stagiu de 3 săptămâni în cursul principal în biochimie WS 2010/11 Institutul de Biochimie Biozentrum Max-von-Laue-Straße Frankfurt am Main Tel.:
2 Cuprins 1 Program general Ajutor pentru crearea unui protocol de laborator Instrucțiuni de bioinformatică Instrucțiuni pentru prepararea tampoanelor Transportorul de peptide TAP Prepararea membranei din celule de insecte Sf9 (Experimentul 1 A) Etichetarea peptidelor cu iodoacetamidofluoresceină (Experimentul 1B) Determinarea afinității de legare (valoarea KD) a unei peptide la TAP (Experiment 1C) Investigarea legării nucleotidice a TAP (Experiment 1D) Test de transport peptidic (Experiment 1E) Caracterizarea funcțională a domeniului de legare a nucleotidelor MDL Supraexprimarea MDL1-NBD în E. coli (Experiment 2A) Purificarea MDL1-NBD sau MDL1 (E599Q) -NBD (Experiment 2B) Test de activitate ATPază (Experiment 2C) Dimerizarea mutantului EQ (Experiment 2D) Stingerea fluorescenței pentru a determina constanta de viteză a dimerizării MDL1 (E599Q) -NBD (Experiment 2E)
4 Generalități 3 Examenul pentru întregul stagiu BC-II (PEI, GSH, BC) și cursul de bioanalitică vor avea loc vineri la 9:30 în clădirea Biozentrum N100, sala 0.15. Rezultatele vor fi postate în foaierul Institutului pentru Biochimie și publicate pe site-ul nostru web cel târziu. Pentru a trece examenul, sunt necesare 50% din puncte. Lider de stagiu Prof. Robert Tampé PD. Dr. Rupert Abele Supervizor Christoph Baldauf Dr. Katharina Ceh Irina Bangert Volker Gatterdam Gerda Gündisch Sabine Hulpke Kristin Kiosze Alexander Kleefen Noemi Labòria Tim Lin Sabine Schmidt Gerhard Spatz-Kümbel Franz Tumulka Agnes Wycisk
9 Ajutor pentru crearea unui protocol de internship 8 Exemplu: BEISMANN-DRIEMEYER, S. și TAMPE, R. (2004): Funcția mașinilor de transport antigen TAP în sistemul imunitar celular Angew. Chemie 116, Bibliografia este sortată alfabetic în funcție de primul autor! (Pentru a crea bibliografia, vă recomandăm programul Citavi (gratuit pe pagina principală a universității). F. Anexă În unele cazuri urmează o anexă, care constă de obicei din tabele mai lungi cu date de măsurare sau cifre mai mari. Concluzie Când scrieți protocolul, încercați să fiți complet și clar. După ce ați terminat, citiți din nou textul pentru plauzibilitate, structură și formulare, precum și pentru erori de ortografie și/sau cereți cuiva ajutor!
17 Bioinformatică 16 Această pagină vă oferă o mulțime de informații despre ACE2, inclusiv listarea secvenței de proteine (în codul unei litere) și secvența ADN. Ce puteți spune despre funcția ACE2? Din ce organism a fost clonat? Unde a fost publicată lucrarea de cercetare? Rețineți că există un link către Medline, care vă permite să vedeți rezumatul articolului.
18 Bioinformatică 17 Caracteristicile secvenței includ regiuni precum „cd-uri” (codarea secvenței ADN). Acest lucru vă spune regiunea codificatoare a ADN - regiunea care a fost tradusă pentru a da secvența proteică. În ce poziție începe și se termină secvența de codare? Unele dintre intrările secvenței conțineau mai multe gene. Aruncați o privire la numărul de acces X (Puteți efectua din nou căutarea sau utilizați butonul înapoi al browserului pentru a-l găsi). Afișați această secvență în format grafic (dintr-un link din partea de sus a paginii). Ar trebui să vedeți o pagină ca cea de mai jos. Explorați linkurile de pe această pagină pentru a vedea celelalte informații disponibile despre această regiune. Meniurile Limite și Previzualizare/Index (și comenzile Câmpuri de căutare) sunt mult mai utile atunci când se caută bazele de date de nucleotide și proteine decât în bazele de date din literatură. Puteți găsi o listă cu toate câmpurile de căutare și codurile acestora utilizate în bazele de date secvențiale din manualul de ajutor Entrez aici. Exemplu: Utilizați Limite pentru a găsi toate secvențele umane (cu excepția EST-urilor și STS-urilor) adăugate la baza de date din 1998:
20 Bioinformatică Câte secvențe de nucleotide (cu excepția EST-urilor) din cloroplastele tutunului sunt în bazele de date? 5. Se pare că „Regele” s-a extins de la analiza secvenței ADN-ului la mult timp după moartea sa raportată. Găsiți numerele de acces ale secvențelor ADN raportate de Elvis Aaron Presley. Lectură obligatorie: manualul de ajutor Entrez Entrez Continuați cu următorul secțiune.