Cercetările pot duce la îmbunătățirea tratamentului și a vaccinurilor pentru Ebola, COVID-19;
Disclaimer: Această pagină este o traducere automată a acestei pagini inițial în engleză. Vă rugăm să rețineți, deoarece traducerile sunt generate automat, nu toate traducerile vor fi perfecte. Acest site web și paginile sale web sunt destinate citirii în limba engleză. Orice traducere a acestui site și a paginilor sale web poate fi inexactă și inexactă, în totalitate sau parțial. Această traducere este furnizată într-o practică.
În mijlocul unei pandemii globale cu COVID-19, este greu de apreciat cât de norocoși au fost cei din afara Africii de a evita boala virală mortală a virusului Ebola. Își incapacitează victimele la scurt timp după infectarea cu vărsături masive sau diaree, ducând la moarte din cauza pierderii de lichide la aproximativ 50% dintre cei afectați. Virusul Ebola se transmite numai prin fluide corporale, marcând o diferență principală față de virusul COVID-19 și cel care a ajutat la conținerea Ebola la răspândire.
Focarele de Ebola continuă să înflorească în Africa de Vest, deși un vaccin dezvoltat în decembrie 2019 și îmbunătățiri în îngrijire și izolare au contribuit la menținerea controlului asupra Ebola.
Simulările supercomputerului realizate de o echipă de la Universitatea din Delaware care au inclus un curs universitar susținut de programul de licență XSEDE se adaugă la mix și ajută la spargerea apărării materialului genetic Ebola înfășurat. Această nouă cercetare ar putea duce la descoperiri în tratamentul și îmbunătățirea vaccinurilor pentru Ebola și alte boli virale mortale, cum ar fi COVID-19.
„Principalele noastre constatări se referă la stabilitatea nucleocapsidei Ebola”, a declarat Juan R. Perilla, profesor asistent în departamentul de chimie și biochimie de la Universitatea din Delaware. Perilla a co-scris un studiu publicat în octombrie 2020 în jurnal deAIP al fizica chimiei. El s-a concentrat pe nucleocapsidă, o coajă proteică care protejează împotriva apărării organismului pe care materialul genetic Ebola îl folosește pentru a se reproduce.
Ceea ce am constatat este că virusul Ebola a evoluat pentru a regla stabilitatea nucleocapsidei prin formarea de interacțiuni electrostatice cu ARN-ul său, materialul său genetic. Există un efect între ARN și nucleocapsidă care îl ține împreună. "
Juan R. Perilla, profesor asistent, Departamentul de chimie și biochimie, Universitatea din Delaware
La fel ca coronavirusurile, virusul Ebola depinde de o nucleocapsidă precum o tijă și elicoidală elicoidală pentru a-și completa viața utilă. În special, proteinele structurale numite nucleoproteine se reunesc într-un aranjament elicoidal pentru a încapsula genomul ARN viral monocatenar (ARNs) care formează nucleocapsidă.
Studiul efectuat de Perilla și echipa sa științifică a căutat determinanți moleculari ai stabilității nucleocapsidelor, cum ar fi modul în care este ambalat materialul genetic al ssRNA, potențialul electrostatic al sistemului și dispunerea reziduurilor în acesta. Aceste cunoștințe sunt esențiale pentru dezvoltarea de noi terapii împotriva Ebola. Cu toate acestea, aceste analize rămân dincolo de atingerea chiar și a celor mai bune laboratoare experimentale din lume. Simulările pe computer, totuși, pot și au umplut acest gol.
„Vă puteți gândi la munca de simulare ca la o extensie teoretică a muncii experimentale”, a spus co-autorul Tanya Nesterova, cercetător universitar în laboratorul Perilla. Am constatat ca ARN-ul este puternic incarcat negativ si ajuta la stabilizarea nucleocapsidei prin interactiunea electrostatica cu nucleoproteine in mare parte incarcate pozitiv, a spus.
Nesterova a primit finanțare printr-o îndrumare expertă a XSEDE, care oferă oportunități de muncă, educație și cercetare (AUTORIZĂ) în 2019, care sprijină studenții care participă la lucrările reale ale XSEDE.
„A fost un program eficient”, a spus el. „Am folosit mijloace de calcul, cum ar fi gateway-urile în această vară. De asemenea, am avut o comunicare regulată cu coordonatorul pentru a ne menține progresul pe drumul cel bun. "
Echipa a dezvoltat o simulare a dinamicii moleculare a nucleocapsidei Ebola, un sistem care conține 4,8 milioane de atomi. Au folosit structura de microscopie crio-electronică a virusului Ebola eliberată în natură în octombrie 2018 pentru specificațiile lor în construirea modelului.