Secvențierea următoarei generații BVDH
NGS - Secvențierea următoarei generații
Secvențierea următoarei generații NGS
NGS este o tehnologie inovatoare, a cărei utilizare poate ajuta la clarificarea cauzei multor imagini clinice eterogene.
Atunci când îl utilizați, trebuie luat în considerare dacă elementele relativ complexe, adică diagnosticarea costisitoare are și consecințe clinice.
Comisia " Prin urmare, modelele de facturare legate de diagnostic "ale GfH au funcționat cu Programul de comisioane al BVDH S-au dezvoltat indicații pentru utilizarea NGS.
Tulburări de auz senzorial-neuronale
A fost efectuat un examen de specialitate (FA pentru fonologie și audiologie pediatrică sau FA pentru ORL cu expertiză audiologică pediatrică). Documentarea istoricului medical, rezultatul unui test auditiv obiectiv, de ex. Testarea răspunsului auditiv al trunchiului cerebral (ABR sau BAER, BSER) și istoricul familial sunt disponibile.
excluderea inițială a unei mutații în GJB2 și unul Ștergere în GJB6
Amplitudinea și calitatea tulburării de auz pot duce la o tulburare a dezvoltării vorbirii sau au provocat-o.
Cauzele tulburărilor auditive dobândite au fost excluse - pe cât posibil - de exemplu infecții prenatale „TORCH” (toxoplasmoză, rubeolă, citomegalie și herpes), meningită, tumori, inflamație).
Dacă istoricul familiei permite să se tragă concluzii despre o moștenire, există doar o indicație pentru sub-panoul corespunzător.
Dacă istoricul familial nu permite să se tragă concluzii despre moștenire, există inițial o indicație doar pentru sub-panoul autosomal recesiv.
Tratament-epilepsie refractară/dificilă pentru tratament, generalizată sau focală, cu debut înainte de vârsta de trei ani
înainte de NGS, matricea CGH este obligatorie pentru a exclude CNV cauzal
Diagnosticul obligatoriu al sindromului clinic-genetic, luând în considerare constatările clinice conform EBM GOP 11232 (nou 11234), fără nicio indicație a bolii sindromice monogene specifice
Existența unuia dintre următoarele criterii, precum și excluderea extinsă a unei geneze exogene (adică infecțioase sau traumatice), indicație de către neurologi, neuropediatri sau genetici umani cu documentație scrisă despre evoluția bolii și istoricul familial):
boală sindromică neclară cu convulsii
encefalopatie epileptică care începe în primul an de viață sau epilepsie mioclonică severă în copilăria timpurie (Dravet/SMEI/GEFS +)
aici inițial excluderea unei mutații SCN1A
Malformații structurale congenitale ale creierului
Malformațiile structurale congenitale ale SNC documentate pre- și/sau postnatal în RMN conform uneia dintre categoriile de subpanel enumerate mai jos:
izolat sau împreună cu alte malformații structurale ale SNC sau extracerebrale
Întârzierile dezvoltării psihomotorii și/sau tulburările convulsive sunt obligatorii la copiii cu vârsta peste 2 ani și sunt documentate de către neuropediatrii
heterotopii nodulare periventriculare cortexisodense bilaterale, cel puțin 2 pe fiecare parte
heterotopii ligamentale cortexisodense bilaterale
pachygyria bilaterală, incluzând lizenfafalie clasică sau lizenfalie pavată, generalizată sau accentuată frontal sau accentuată occipital
cu generalizate sau Excluderea obligatorie a licenței clasice accentuate anterior occipital de ștergerea LIS1 (PAFAH1B1) prin intermediul MLPA sau Miller-Dieker-PESTE și secvențierea obligatorie a genei LIS1 (PAFAH1B1)
la băieți sau fetuși cu cariotip 46, XY și generalizat sau Excluziunea obligatorie a mutației DCX folosind MLPA pentru lisenfafalie clasică subliniată anterior și Secvențierea
tulburare de organizare neuronală ca polimicrogirie sau asemetrică PMG, simetrică sau extinsă Imagistica RMN nu este tipică displaziei corticale focale (FCD)
Înainte de NGS, matricea CGH este obligatorie pentru a exclude diagnosticul cauzal al infecției cu CNV și, dacă este disponibil, peripart, fără referire la agenții patogeni frecvenți cauzali ai infecțiilor intrauterine (dacă este posibil TORCH)
HPE-MLPA obligatoriu sau Array-CGH, cu poz. Istoricul familial și/sau incisivul superior singular inițial excluderea obligatorie a genei mutației SHH și a genei SIX3 prin intermediul secvențierii
microcefalie congenitală cu circumferința capului pre- sau perinatală mai mică/egală cu -3 SD
matricea CGH obligatorie anterior pentru a exclude CNV cauzal și Analiza cromozomului
Malformații structurale cerebrale sindromice neclasificate, posibil și metabolice sau mitocondriale la copiii după vârsta de 2 ani, este obligatorie întârzierea psihomotorie profundă și/sau epilepsia dificil de tratat, care este documentată de un neuropediatru specialist, este obligatorie
Diagnosticul obligatoriu al sindromului clinic-genetic, luând în considerare constatările clinice conform EBM GOP 11232 (nou 11234) fără nicio indicație a bolii sindroame monogene specifice
Colestază timpurie timpurie și colestază juvenilă
Diagnosticul confirmat al colestazei copilăriei timpurii/juvenilă prin proceduri imagistice (sonografie și/sau MRT/CT/ERCP) și Histologie hepatică (cu excepția cazului în care există o contraindicație clinică pentru o biopsie) și constelația obligatorie a constatărilor de laborator și, în același timp, excluderea extinsă a unei cauze infecțioase, autoimune și oncologice a aceleiași
defecte congenitale ale sintezei acidului biliar: Descoperiri de laborator de stabilire a tendințelor, în special scăderea selectivă a acizilor biliari în plasmă și anomalii în analiza acizilor biliari în urină
Boli peroxisomale/hepatopatie cu simptome neurologice: simptome neurologice suplimentare și/sau vizibile imagini ale SNC pionierat și/sau diagnostice vizibile de pionierat de laborator într-un laborator metabolizat specializat
Hepatopatii cu diskinezie ciliară/fibroză hepatică congenitală: în biopsia ficatului dovezi de malformație a plăcii ductale și/sau afectare nefrologică (de exemplu chisturi renale) și/sau tulburări de lateralizare (heterotaxie, de exemplu situs inversus)
Boli colestatice datorate bolii mitocondriale: Examenul gastroenterologic pediatric de specialitate anterior obligatoriu plus rezultatele tipice de laborator pentru mitocondropatie (de exemplu lactat crescut) sau prezența suplimentară a simptomelor neurologice indicative (de exemplu miopatie, tulburări vizuale, tulburări auditive, epilepsie, ataxie)
Colestază intrahepatică progresivă familială (PFIC) valori scăzute sau normale ale GGT în ser în colestaza intrahepatică
Colestaza cu hipoplazie a căilor biliare Histologie hepatică: scăderea numărului de căi biliare și dovezi clinice ale bolii sindromice subiacente (de exemplu, sindromul Alagille)
Colestază prelungită neclasificată timpurie și/sau juvenilă, posibil și cu malformații suplimentare de organ, de asemenea sindromice, metabolice sau mitocondriale: Examenul gastroenterologic pediatric de specialitate obligatoriu anterior și diagnosticul sindromului clinic-genetic, luând în considerare constatările clinice conform EBM GOP 11232 (nou 11234) fără referire la boala sindromică sau monogenă specifică care poate fi înregistrată mai eficient din punct de vedere al costului folosind alte metode de examinare (de exemplu, boala Wilson, boala Meulengracht, CF)
Distrofii retiniene ereditare
Indicație pentru pacientul index în familie de către un specialist în oftalmologie cu documentarea leziunilor bilaterale de retină pe aceeași parte pe baza constatărilor direcționale din imagistica retiniană (oftalmoscopie, autofluorescență a fundului, tomografie cu coerență optică de înaltă rezoluție) și/sau diagnostic funcțional al retinei (ERG, flicker, EOG). La debutul bolii, diferențierea între distrofiile centrale ale retinei (boala cea mai bună, retinoschizis juvenilă legată de X) și distrofiile generalizate ale conului (indicarea evoluției bolii). Diferențierea formelor staționare de cele progresive ale distrofiilor retiniene. Formele de degenerescență retiniană dobândite anterior trebuie excluse.
În cazul unei constelații tipice de constatări pentru o boală Norrie, este obligatorie excluderea genetică moleculară a mutațiilor NDP prin secvențierea convențională Sanger și, eventual, MLPA.
În cazuri excepționale justificate, dacă se suspectează moștenirea recesivă legată de X și lipsește materialul de testare al unui pacient cu indice masculin, este posibilă și examinarea femeilor cu risc cu lipsă de manifestare clinică, cu penetranță redusă cunoscută și expresivitate variabilă.
retinita pigmentara bilaterala
distrofie bilaterală con-tijă
Amauroza ficatului congenital
Sindromul Usher Retinită pigmentară obligatorie cu pierderea progresivă a auzului fără a afecta sistemul vestibular
Sindromul Bardet-Biedl Distrofia conului obligatoriu a tijei și cel puțin alte 2 manifestări extraretinale, cum ar fi polidactilia, întârzierea mintală, obezitatea stem cu greutate> P97, malformații renale și/sau disfuncție renală
Obligatoriu pre- sau perinatal sau până la vârsta de 5 ani Descoperirile biometrice direcționale, inclusiv fizicul și/sau structura osoasă disproporționată, trebuie verificate în imagistică utilizând ultrasunete prenatale și/sau RMN fetal sau obligatorii postnatal folosind diagnostice cu raze X/CT și, dacă este necesar, descoperiri histologice post mortem.
izolat sau împreună cu malformații în afara sistemului osos
Confirmarea constatărilor prin ecografie de organ este obligatorie pentru fiecare diagnostic prenatal conform calificării DEGUM II sau III
posibil și pe materialul testat de la un făt suspect sau pacient decedat, în cazuri excepționale justificate și de la mama pacientului index sau alte rude de gradul I cu dorința specifică pentru copii
Condrodisplazie pre- sau perinatală cu sau fără distrofie toracică
în cazul rizomeliei și/sau toracelui îngust, excluderea mutațiilor hotspot specifice în FGFR3 pentru acondroplazie și/sau displazie thanatoforică
Displazia scheletică cu luxații multiple articulare
Osteogeneza imperfectă și alte displazii scheletice cu densitate osoasă scăzută
Displazia scheletului în mucopolisacaridozele și alte boli de depozitare
Displazii scheletice cu densitate osoasă crescută
Displazia scheletică sindromică cu cel puțin o malformație suplimentară a organelor structurale (de exemplu, renale, cardiace, cerebrale): diagnostic medical specializat anterior pediatric și/sau prenatal și documentare a malformațiilor organice suplimentare prin imagistică (de exemplu, ultrasunete, MRT) și, dacă este necesar, diagnostic funcțional și diagnostic obligatoriu de sindrom clinico-genetic de specialitate, luând în considerare constatările clinice conform EBM GOP 11232 (nou 11234)
Imunodeficiență primară severă în copilărie
Examen specializat pediatric-hematologic-oncologic cu constelație de laborator/constatări hematologice și eventual. constatări tipice în puncția măduvei osoase, precum și cea mai mare excludere posibilă a factorilor cauzali exogeni sau a formelor sindromice monogene, care pot fi diagnosticate mai ieftin cu alte metode, inclusiv secvențierea Sanger.
Citopenii cauzate neimunologic sau anemii aplastice
Citopenia persistentă a uneia sau mai multor linii celulare hematologice demonstrată în cel puțin 2 examinări independente cu sau fără manifestări clinice.
Citopenii imune sau anemie aplastică
Suspiciune de citopenie imună în una sau mai multe linii celulare hematologice cu sau fără simptome clinice cu constatări tipice de laborator/hematologice și puncție tipică a măduvei osoase și fără Dovezi morfologice ale insuficienței hematopoietice (DD: anemie aplastică).
Opțional Detectarea altor reacții autoimunologice în diferite organe țintă. Detecție opțională a celulelor T CD4/CD8
Imunodeficiență congenitală severă (SCID)
Infecții repetate atipic severe obligatorii care necesită tratament antibiotic și/sau internat și cel puțin un criteriu opțional suplimentar: